2021年：球队成立

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2021–22年香港超级联赛，因应有两支球队退出，香港足球总会于2021年8月26日宣布，将筹组另一队以U23球员为主的足球队。[1]2021年9月2日，足总确认香港U23足球队成立，作为联赛第8支球队，队伍的运作将维持至少三年。香港U23设定为全华班球队，并设有“注5出3”超龄球员限制，其余球员则符合“本地U23青年球员”的注册身份。[2][3][4]

香港U23足球队的担保有限公司“HKU23 Limited”于2021年9月28日完成注册[5]，香港足球总会随即展开球员的注册及各项行政程序。[6]球队于10月2日启动社交媒体平台（包括 facebook 及 instagram），同时公布球会会徽，迎接10月5日的首场赛事。[7]10月17日，香港U23于菁英杯赛事以 2-1 反胜港会，取得历史首场胜仗。[8]

2022年︰进一步年青化

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2022年8月2日，香港U23足球队于社交网站宣布由司徒文俊顶替张健峰担任球队主教练。[9]2022年8月18日，球队正式开操，并宣布签入10名新球员，平均年龄由21.3岁降至20.6岁。球会班费及方针不变。[10]

2023–2024年球季

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2023年7月初，宣布多名超龄球员及适龄球员离队，包括黄浩然转投东方，张俊轩，郭子楷，罗晓聪，黎培基转投澳门球会蒙地卡罗，袁世杰。龙门厐焯熙回归晋锋，龙门颜翱天转投冠忠南区，后卫陈润潼转投冠忠南区，后卫李俊谚，中场林乐贤。

2023年7月4日，公布签入中坚杜国梁作为其中一名新加入的超龄球员。

2023年7月5日，公布签入前锋林学曦作为第二名新加入的超龄球员。

2023年7月6日，公布签入攻击中场郑俊泓作为第三名新加入的超龄球员。

2023年7月8日，公布签入防守中场李卓轩球衣号码为66号。

2023年7月20日，宣布签入年青龙门邓梓朗29号及晋峰外借龙门袁逸朗44号。

2023年8月4日，宣布郭子堦回巢成为第五个超龄球员。

2023年8月16日，宣布杰志外借华人年青中坚曾以行加盟。

2024年5月。会长霍启山宣布三年计划已完成。足总筹备香港U22联赛，香港U23宣布正式解散，各球员可以自由转会。